При переносе программы на карту памяти переносятся не все данные, а только большая часть.
По поводу того, что можно удалять - разные производители телефонов пихают в стандартную прошивку свои разные программы... Выложите тут список того, что находится у Вас в папке /system/app, я скажу что не нужно точно