Перед отключением телефона от компьютера в трее нажмите на значок USB левой кнопкой мыши и выберите Извлечь. После этого в самом телефоне в панели уведомлений (сверху) тоже выберите Отключить карту. После этого можно отсоединять.
Если, проделывая все эти манипуляции, по-прежнему происходит повреждение карты памяти, то что-то не так с вашим телефон и его нужно сдать на диагностику в сервис.