Если делать сброс всех настроек, то да - удалятся все пользовательские данные.
А если только очистку кэша, то будут удалены только данные, отосящиеся к тому приложению.
В любом случае рекомендуется предварительно синхронизировать всю нужную информацию с сервисами Google.